As pedras de ar são uma parte essencial de um sistema aquapônico. A falha em fornecer boa aeração para peixes e plantas é uma das questões mais comuns que vemos em sistemas domésticos e comerciais.
As pedras de ar geralmente são criadas por compósito de arenito ou vidro ligado. Quando uma bomba de ar fornece ar para a pedra de ar, o ar é então difundido em bolhas muito finas. Estas pequenas bolhas irão então expor mais área de superfície da água ao ar, o que aumenta o oxigênio* dissolver na água.