एक बायोफिल्टर एक एक्वापोनिक प्रणाली के भीतर एक घटक है जो अमोनिया के नाइट्रेट्स में रूपांतरण को उत्प्रेरित करता है और फिर फायदेमंद बैक्टीरिया के लिए आदर्श वातावरण प्रदान करके नाइट्रेट्स में होता है। नाम से पता चलता है कि कोई “यांत्रिक निस्पंदन” नहीं है।
मछली टैंक से पानी मछली से अमोनिया के साथ इस बायोफिल्टर में प्रवेश करता है। घटक तब इस पानी को किसी प्रकार के मीडिया के साथ जोर से बुलबुले करता है जो बैक्टीरिया के लिए सतह क्षेत्र बनाता है। चूंकि यह बैक्टीरिया एरोबिक वातावरण में पनपती है, अमोनिया से नाइट्रेट्स का रूपांतरण काफी तेज होता है। ये नाइट्रेट्स पौधों द्वारा अपने स्वादिष्ट भोजन को विकसित करने के लिए उपयोग करते हैं।