वायु पत्थर एक एक्वापोनिक प्रणाली का एक अनिवार्य हिस्सा हैं। मछली और पौधों के लिए अच्छा वातन प्रदान करने में विफलता घर और वाणिज्यिक दोनों प्रणालियों में दिखाई देने वाले अधिक आम मुद्दों में से एक है।
वायु पत्थर आमतौर पर बलुआ पत्थर समग्र या बंधुआ ग्लास द्वारा बनाए जाते हैं। जब एक वायु पंप हवा के पत्थर को हवा प्रदान करता है तो हवा को बहुत अच्छे बुलबुले में फैलाया जाता है। ये छोटे बुलबुले तब पानी के अधिक सतह क्षेत्र को हवा में उजागर करेंगे जो पानी में* भंग ऑक्सीजन* को बढ़ाता है।