فالمرشح الحيوي هو مكون داخل نظام أكوابوني يحفز تحويل الأمونيا إلى نترات ثم إلى نترات من خلال توفير بيئة مثالية للبكتيريا المفيدة. لا يوجد «الترشيح الميكانيكي» كما يوحي اسمها.
المياه من خزانات الأسماك تدخل في هذا الفلتر الحيوي مع الأمونيا من الأسماك. المكون ثم فقاعات هذه المياه بقوة مع شكل من وسائل الإعلام التي تخلق مساحة السطح للبكتيريا. لأن هذه البكتيريا تزدهر في البيئات الهوائية، وتحويل الأمونيا إلى النترات يحدث بشكل أسرع بكثير. ثم تعتاد هذه النترات على النباتات لزراعة طعامك اللذيذ.